PADRAO ESPACIAL DOS LOCAIS DE LIGAÇAO DOS FACTORES DE TRANSC IBD

Sinopse

O corpo de um mamífero é constituído por mais de 200 tipos de células, quase todas com o mesmo genoma mas com morfologia e funçoes diferentes. Estas diferenças devem-se à maquinaria de regulaçao genética específica de cada célula. O genoma dos mamíferos tem uma organizaçao complexa de sequências reguladoras associadas a diferentes elementos reguladores. O ADN linear no núcleo é dobrado de uma forma muito complexa e esta dobragem aproxima regioes distantes umas das outras. A combinaçao de diferentes proteínas de ligaçao ao ADN, como os factores de transcriçao e as histonas, as marcas epigenéticas, como a posiçao do gene e a modificaçao dinâmica do ADN e das histonas, e a organizaçao tridimensional da paisagem reguladora interagem de forma generalizada e específica da célula para gerar padroes de expressao espácio-temporais complexos. As abordagens de imunoprecipitaçao da cromatina (ChIP seq) e de captura da conformaçao dos cromossomas (Hi C e 5C) podem ser integradas na sequenciaçao shotgun do transcriptoma completo (RNA-Seq) para decifrar o padrao espacial de ligaçao dos elementos reguladores aos seus genes-alvo.